《黄帝内经》、《难经》及《神农本草经》成书于秦汉时期，是重要的医学着作，奠定了中医药学的理论基石。三者共同建构中医药学体系，至今仍是核心经典。

《黄帝内经》

《黄帝内经》分为《素问》和《灵枢》两部分，篇章多以黄帝与精通医术的岐伯所进行的问答展开，通过一问一答的方式阐述多个中医核心理论。《素问 • 阴阳应象大论》提出「阴阳者，天地之道也」，将阴阳视为生命活动的根本法则。生理上「阴平阳秘」则健康，病理上「阴阳失调」则病。诊治强调「察色按脉，先別阴阳」，确立中医辨证论治的核心框架，指导临床补泻调和。《素问 • 阴阳应象大论》以五行阐明脏腑间生剋制化关系。肝、心、脾、肺、肾分属五行，生理上相生相剋，病理上相乘相侮。五行应用于诊断如面色和脉象、治疗如「虚则补母，实则泻子」，形成脏腑辨证体系。《灵枢 • 经脉》详述十二经脉循行路缐，内连脏腑，外络肢节，以运行气血。经脉失调则相应部位病变，如「肺手太阴之脉」病见咳喘。针灸治疗依经取穴，调气导血，奠定经络学说临床应用基础。《素问 • 五藏別论》以「藏精气而不泻」定义五脏，「传化物而不藏」区分六腑。脏腑各司其职，如肝主疏泄、胃主受纳；而病理上相互影响，如肝火犯肺。诊治多以五脏对应五行进行整体调节（例如滋水涵木，即透过滋养肾以养肝），构建中医藏象学说核心。《素问 • 至真要大论》提出「风、寒、暑、湿、燥、火」为外感病因。风性开泄，寒主收引，暑多挟湿，湿性黏滞，燥易伤津，火性炎上。六淫可单独或兼夹致病，与体质、环境相关，导致外感病或诱发内伤杂病。

《难经》

部分古代医家认为《难经》是战国时期的名医扁鹊所撰。《难经》补《黄帝内经》经络理论之未备，当中记载：「奇经八脉者，不拘于十二经。」奇经八脉纵横交错于十二经脉之间，具有加强经脉间联系、调节经脉气血的作用。《难经 • 一难》首次提出「独取寸口」脉诊法，谓「寸口者，脉之大会」。寸口脉象确立脉诊标准化定位，寸、关、尺反映五脏六腑之气，并可从脉象浮沉变化得知病情轻重。而扁鹊重视切脉，《难经》多篇讨论脉学的内容与其医学专长相符。《难经 • 三十六难》提出「肾两者，非皆肾也，左为肾，右为命门」。命门为「诸神精之所舍，原气之所系」，病理见「男子藏精，女子系胞」失常，强调肾的多样化功能及其在人体的重要性。

《神农本草经》

《神农本草经》是中国最早的药物学经典，系统记载365种药物。其首创药物的上、中、下三品分类，「上药一百二十种为君，主养命以应天」，「中药一百二十种为臣，主养性以应人」，而「下药一百二十五种为佐使，主治病以应地」。上品久服无毒可延年，中品调理虚实需斟酌，下品攻邪治病不可久服。此分类确立中药应用层级，为后世药物毒性分级奠定基础。《神农本草经》记载药物的四气（温、热、寒、凉）及五味（酸、苦、甘、辛、咸）， 例如薏苡仁味甘微寒，四气调阴阳，五味入五脏。临床寒者热之，热者寒之，辛散、甘补、酸收、苦降、咸软。药性与药味相合，共同发挥治疗作用，调和人体气血阴阳。