香港中医医院积极支持研究发展，并与本港、海外及中国内地之大学及教育机构紧密合作，以推动实证为本的临床科研（中医药和中西医协作）、中西药相互作用研究（作为平台中央行政机构）、中医理论深化研究、中成药临床应用研究和中成药新药临床研究。为协助进行临床研究之发展，我们建立了设有20张病床的临床试验及研究中心。中心旨在为进行第一和第二期临床试验而设计，以促进新中成药的开发，进一步扩阔现有中成药的新临床适应症。

为进一步促进香港中医研究的蓬勃发展，香港中医医院为中医、西医及相关医护人员提供培训，以提升人员的科研能力，积极推广科研成果的临床应用。