香港中醫醫院積極支持研究發展，並與本港、海外及中國內地之大學及教育機構緊密合作，以推動實證為本的臨床科研（中醫藥和中西醫協作）、中西藥相互作用研究（作為平台中央行政機構）、中醫理論深化研究、中成藥臨床應用研究和中成藥新藥臨床研究。為協助進行臨床研究之發展，我們建立了設有20張病床的臨床試驗及研究中心。中心旨在為進行第一和第二期臨床試驗而設計，以促進新中成藥的開發，進一步擴闊現有中成藥的新臨床適應症。

為進一步促進香港中醫研究的蓬勃發展，香港中醫醫院為中醫、西醫及相關醫護人員提供培訓，以提升人員的科研能力，積極推廣科研成果的臨床應用。