藏象学说认为，人体的各个脏腑虽各有所司，具有不同的生理功能，但它们之间并不是孤立的，脏与腑之间有着特定的络属关系。二者互为表裏，在经络上相互络属，生理上相互为用，病变时相互影响。而在这种脏腑的相互关系中，五脏是起主导和决定作用的。当中，心与小肠相表裏，肺与大肠相表裏，肝与胆相表裏，脾与胃相表裏，肾与膀胱相表裏。因此，当一脏或腑出现病理现象时，常考虑其相应脏腑的功能。例如，临床上治疗尿血时常考虑是否因心火移热小肠而致而于处方中使用清心火的药物，或是在治疗便秘时，也常通过肃降肺气的方法去恢復大肠的传导功能。

藏象学说的形成有赖于古代医家对人体生理、病理现象的长期观察，通过反覆的诊断与治疗效果的相互印证，逐渐累积有关各脏腑活动规律的知识，他们总结了丰富的医疗经验，也使藏象学说的理论变得完善。