中醫藥文化植根香港，涼茶、跌打、蛇酒及中醫傳統製劑方法被錄入「香港非物質文化遺產」清單中，當中涼茶更於2006年列入第一批「國家級非物質文化遺產代表性項目名錄」。這種略帶甘苦的飲品，是嶺南中醫藥文化的結晶，體現了嶺南人民因地制宜、藥食同源的養生智慧，嶺南地區氣候濕熱、疫病多發，在長期的實踐當中，中醫都能善用清熱解毒、健脾祛濕等方藥以防治疾病。香港地處嶺南，中醫藥在香港的醫療體系中一直佔有重要地位，長久以來為人們的健康作出顯著貢獻。

在19世紀開埠初期，香港政府對傳統中醫藥採取不干預政策，中醫多以自僱自營的方式執業。而1869年的政府憲報中有一條法例指出，規定運載香港華人民工至海外謀生的船隻上必須載有與船上人數成比例的中草藥數量，以製作成涼茶供船上華人緩解不適，可見當時人們對中草藥的肯定。

至1872年，香港第一間華人醫院—東華醫院成立，為貧苦市民提供免費中醫藥服務。

在1989年8月，香港政府成立了中醫藥工作小組，負責檢視香港中醫師的執業情況、中醫藥在本港的使用情況，以及就推廣中醫藥的正確使用和確保中醫藥的專業水平提供意見。

隨後在1990年4月，第七屆全國人民代表大會第三次會議通過《香港特別行政區基本法》，其中第138條規定：「香港特別行政區政府自行制定發展中西醫藥和促進醫療衞生服務的政策。社會團體和私人可依法提供各種醫療衞生服務。」

香港政府亦在1995年成立香港中醫藥發展籌備委員會（籌委會），負責就如何促進、發展和規管香港中醫藥提供建議。而籌委會推行的「香港中醫登記計劃」有近7000名中醫獲得登記，當中收集的資料為日後制定註冊準則提供框架。同年，衞生署主辦世界衞生組織地區性傳統醫藥研討會。

在1997年3月，籌委會就中醫藥規管架構及未來發展提交報告書。至此，中醫藥於香港走向更規範、更蓬勃的發展，為香港中醫藥的發展奠定基礎。

香港特別行政區成立後，政府在《1997年施政報告》中宣布將設立法定架構，以評核和監管中醫的執業水平、承認中醫的專業資格，以及規管中藥的使用、製造和銷售。

自1998年起，香港浸會大學、香港中文大學及香港大學相繼開辦中醫藥相關的本科課程，培育本地中醫藥專業人才。

而立法會亦在1999年7月正式通過《中醫藥條例》（香港法例第549章），為中醫藥在香港醫療體系內的發展奠定良好基礎。

為配合政策發展方向，自2003年開始，特區政府委任醫院管理局在全港18區逐步設立中醫教研中心（後稱「中醫診所暨教研中心」），推動以「教」與「研」為本的中醫服務。

在《2014年施政報告》中，特區政府宣布在將軍澳預留一幅土地，作興建香港首間中醫醫院之用。而在《2017年施政報告》中，特區政府宣布出資興建香港首間中醫醫院，並以招標方式挑選合適的非牟利機構負責管理、營運及保養該醫院。

特區政府於2018年5月2日成立中醫醫院發展計劃辦事處，負責推動香港首間中醫醫院的規劃和發展。

其後，在《2018年施政報告》中，特區政府宣布將透過政府資助特定的中醫藥服務，將中醫藥納入本港醫療系統，當中包括在香港首間中醫醫院提供一系列的政府資助門診和住院服務；同時，設立「中醫藥發展基金」以提升業界整體水平，其中目標包括為香港首間中醫醫院培養所需人才。

在2024年5月，醫務衞生局中醫藥發展專員履新，負責帶領醫務衞生局轄下的中醫藥處，即負責在政策層面統籌和促進香港中醫藥發展的專責組別，與中醫藥界持份者保持緊密聯繫，共同構建中醫藥發展藍圖，完善政策頂層設計，並監督中醫藥範疇相關的政策事宜。同年10月9日，香港首間中醫醫院獲正式命名為「香港中醫醫院」，並公布其院徽。

2025年12月11日，香港中醫醫院正式落成並分階段開展門診、日間住院及住院服務。作為香港首間以中醫服務為主的醫院，其將帶領本地中醫藥服務由基層醫療邁進第二和第三層醫療服務，是香港中醫藥發展的重大突破。

作為香港中醫藥旗艦機構和三間本地大學的中醫藥教學醫院，香港中醫醫院肩負五大發展任務，包括醫療服務、教學及培訓、科研、多方協作及創造健康價值。

香港中醫醫院積極發揮「轉化者」角色，將與中醫藥業界多方正面互動，促進中醫藥在本港、粵港澳大灣區的發展，並憑藉香港在「一國兩制」下「背靠祖國、聯通世界」的獨特優勢，助力香港成為中醫藥走向世界的橋頭堡，為國家中醫藥發展大局作出貢獻。