宋朝，是中醫兒科發展的重要朝代，錢乙是當時著名的兒科學專家，他與他的著作留下了仍為現今醫師可學可用的寶貴理論和經驗。

錢乙曾因為長公主的女兒治病有功，而獲翰林醫官職位。翰林醫官院是一個掌管醫療政令和事務的部門，太醫局則掌管教學事務，這是當時政府爲了加強醫事管理，把醫藥行政與醫學教育分立的措施。

和不少中醫典籍一樣，《小兒藥證直訣》都是由醫家的弟子整理而成, 但有趣的是編書者閻季忠本來是錢乙的病人，六歲時重病危殆，獲錢乙治癒後，將機緣巧合所獲的錢乙醫方及著作整理成書。

本書記載了錢乙的學術思想，總結了他的兒科臨床經驗，在中醫兒科學中起承先啓後的作用。

診斷上，錢乙於兒科應用《黃帝內經》的主張，從面部不同區域的顔色及眼部不同顔色來診察小兒的五臟疾病，稱為「面上證」及「目內證」。

錢乙善於從古方中變化，創制新方，流傳至今廣泛應用的六味地黃丸，就是錢乙從東漢《金匱要略》腎氣丸中，按當時小兒體質去掉桂、附這兩種溫熱藥物，治療小兒先天腎虛的方劑。

錢氏學術重視五臟辨證，就是透過辨別小兒心肝脾肺腎的虛實，制定相應方劑，亦重視五臟間的相生相剋關係。

青色於五行中屬木，肝亦屬於木，瀉青丸是錢乙用於清瀉肝火的方劑。

赤色（亦即紅色）屬火，心亦屬於火，導赤散透過木通及竹葉通利小便，讓心火從小便導出，治療小兒心熱病症，清《醫方集解》亦記載其能治療面紅狂躁、口爛舌瘡、咬牙口渴等一系列症狀。

《小兒藥證直訣》記載了一個叫弄舌的特別病症，當脾臟微熱時，就會令舌絡微緊，時時需要舒舌，書中提醒這種情況並非大熱，不應使用過分寒涼藥物，應該慢而少量服用瀉黃散，黃色於五行中屬土，脾亦屬於土，後世引用此方治療脾胃伏火。

白色於五行中屬金，肺亦屬於金，瀉白散就是一條瀉肺熱的有效方，治療小兒喘嗽。

《小兒藥證直訣》中所載的方劑大約有140條，其中大部分為丸散膏一類的成方成藥，一來可以預先製備，方便及時使用應付病情變化，亦易為小兒所接受。書中還記載了浴體法，醫師為嬰兒以藥液洗浴，治療中醫兒科中胎肥、胎熱、胎怯等疾病。發展至今，藥浴療法對於小兒外感發熱、嬰兒濕疹等疾病仍為一個不需口服藥物的選項。